碧根果储藏在冷库是保持其新鲜的色、香、味，以及防止害虫侵扰的最佳方法。

实验表明,虽然冷冻可能会造成质量上细微的损失,但碧根果不会遭受任何伤害。解冻后,如果保持凉爽，仍可以保存数周。因为碧根果的含水量非常低(4%),未使用的碧根果可多次反复冷冻而不会影响到其质量和结构。

根据J.G.WOODROOF 博士和E.K. KEATON先生在乔治亚州格里芬格鲁吉亚实验站的研究结果,选择合适的运输方式对保持碧根果的品质非常重要。冷藏集装箱是最适合长途海运到国外的运输方式。然而,许多碧根果出口在非冷藏条件下出口也没有质量损失,特别是在寒冷的天气。但是在气温比较高的季节（3月到9月）必须使用冷藏集装箱运输。客户收到碧根果后，强烈建议保存在冰箱或者冷库内。温暖的环境会破坏碧根果的品质。

冷冻后的碧根果需要放置在密闭的容器里。碧根果仁容易吸收其它食物的气味，因此，最好将碧根果置入塑封袋中放入冷冻室。碧根果通常去壳储藏，因为这样既节省空间，也可以直接从冷冻室拿出来食用。带壳的碧根果储藏时间远远久于去壳碧根果。不建议大家常温下存储碧根果。在4℃（华氏40度）温度下冷藏，去壳碧根果保鲜期将近6个月，带壳碧根果保鲜期大概9-12个月。在-18℃（华氏0度），密封装的去壳碧根果保质期可以延长至2年或者更久。冷冻状态下，带壳碧根果保质期也可以达至2年或更久。